В районе подмосковного селения Истра места удивительным образом напоминают окрестности Иерусалима в Палестине. В 1656 г. начались работы по воплощению в жизнь грандиозного замысла патриарха Никона. Из Святой земли патриарху были доставлены чертежи, планы и точная модель храма Воскресения Христова в Иерусалиме, а также чертежи Вифлеемского храма. 

Работы шли под его личным наблюдением (он жил рядом в скиту). В 60 км. от Москвы возникал "Новый Иерусалим" - архитектурно - ландшафтная икона, совместившая в себе образы многих палестинских святынь.

В центре ансамбля - храм Воскресения Христова, представляющий довольно точное подобие знаменитого храма в Иерусалиме. Рядом - церковь Рождества Христова - напоминание о Вифлееме, месте рождения Спасителя. К северу от обители - село Скудельничье (Микулино), к северо - западу - горы Фавор и Ермон.

У стен монастыря - березовая роща, названная Гефсиманским садом. Реку Истру патриарх переименовал в Иордан, а небольшой ручеек, протекающий у подножия монастырского холма, в поток Кедронский.

В 1919 г. Воскресенский Ново-Иерусалимский монастырь закрыли, монашескую общину упразднили. В 1920 г. на базе монастыря создан Художественно-исторический музей, коллекцию которого составили экспроприированные и национализированные ценности ризницы монастыря. Большой ущерб архитектурному ансамблю был нанесен в годы Великой Отечественной войны. Отступавшие германские войска 10 дек. 1941 г. взорвали Воскресенский собор и его колокольню, Дамасскую и Елизаветинскую башни, Святые врата обители, сожгли другие постройки. В послевоенные годы трудом отечественных реставраторов комплекс зданий в целом удалось восстановить.

В 1994 г. вновь был возобновлен Воскресенский Ново-Иерусалимский, ставропигиальный мужской монастырь. В 1995 г. возвращены Церкви Воскресенский собор с земляной церковью свв. Константина и Елены, храм Рождества Христова, скит патр. Никона, восточный братский корпус. В монастыре поновлена церковь свв. Константина и Елены, отреставрированы придел Архистратига Божия Михаила и Всех Сил бесплотных, Усекновения главы Крестителя Господня Иоанна Предтечи, которые освящены малым чином.

Чином великого освящения Святейшим Патриархом Московским и всея Руси Алексием освящены отреставрированные соборный храм Рождества Христова в 1997 г. и придел Успения Пресвятой Богородицы в 1999 г. Открыта Кувуклия - Гроб Господень, после завершения демонтажа строительных лесов в Ротонде. Ист.-арх. и худ. музей «Новый Иерусалим» возвратил монастырю древнюю святыню - мощи мц. Татианы.